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文章出處: 網(wǎng)責(zé)任編輯: 作者: 2018-12-08 16:54:00

 Beck強(qiáng)調(diào)稱:雖然機(jī)器學(xué)習(xí)確實(shí)能夠在特定診斷任務(wù)當(dāng)中發(fā)揮重要的輔助作用,對于人工智能能否最終逾越并完全取代人類病理學(xué)家這樣的問題。但為病人找到最佳治療方法仍然需要多種類型臨床信息的配合,包括細(xì)胞染色、蛋白質(zhì)注釋、基因概括以及電子健康記錄等等。只有將這些信息進(jìn)行認(rèn)真篩選與組合,才干制定出明確的診斷與治療計(jì)劃。這種綜合能力正是人類病理學(xué)家的價(jià)值所在Beck認(rèn)為,人工智能自身并缺乏以解決這個(gè)問題。

讓我先聊聊病理學(xué)家們?nèi)绾握热祟惿氖紫取?/p>

外科醫(yī)生就會從該潛在腫瘤處提取一個(gè)小小的柱狀活體樣本,當(dāng)發(fā)現(xiàn)患者胸部掃描顯示肺部位置存在可疑腫塊。由病理學(xué)家進(jìn)一步提取極薄的組織切片放在載玻片上通過顯微鏡進(jìn)行觀察,判斷細(xì)胞中是否存在癌變跡象。最后,由醫(yī)生著手治療。

或是將顯微鏡下觀察到某些良性細(xì)胞誤判為癌細(xì)胞。后一種情況下,但這樣一個(gè)診療的過程也有局限性。即便是專業(yè)的病理學(xué)家和醫(yī)生也有可能忽略真正的癌細(xì)胞。病人將接受毫無必要的保守化療。

這個(gè)問題將在很大水平上被解決。利用大量數(shù)字化影像進(jìn)行訓(xùn)練,而借助人工智能。人工智能系統(tǒng)能夠提供準(zhǔn)確率遠(yuǎn)超人類病理學(xué)家的診斷結(jié)論,甚至發(fā)現(xiàn)頂尖病理學(xué)家也無法發(fā)現(xiàn)的極為細(xì)小的病征。也就是說,針對于癌癥,人工智能將為醫(yī)生和病理學(xué)家提供重要的診斷與治療建議,并且這個(gè)過程有望在幾秒鐘之內(nèi)完成。

機(jī)器將使日益復(fù)雜的現(xiàn)代醫(yī)學(xué)變得更易于管理,無疑。而人機(jī)組合的方式也將逾越單一一方的表示,給未來醫(yī)學(xué)發(fā)展帶來新的突破。

由機(jī)器學(xué)習(xí)算法驅(qū)動的各類診斷工具已經(jīng)進(jìn)入臨床市場,過去的一年中。協(xié)助醫(yī)生在極少甚至根本無需人工輸入的前提下輕松發(fā)現(xiàn)手腕骨折、糖尿病并發(fā)性眼疾以及中風(fēng)等病征。然而,這些早期應(yīng)用僅僅負(fù)責(zé)自動完成專家診斷及醫(yī)師執(zhí)行方面的任務(wù),一般涉及解釋X光機(jī)片與CT掃描等影像。這類軟件在分析精度與準(zhǔn)確率方面略微優(yōu)于訓(xùn)練有素的人類專家,且具備極為明顯的速度優(yōu)勢。然而,還不能從根本上擴(kuò)展診斷規(guī)模。

AI病理學(xué)的發(fā)展更具有突破性。相比之下。

2019年美國食品與藥物管理局(簡稱FDA 或?qū)⑴鷾?zhǔn)多家公司在病理學(xué)領(lǐng)域的第一款A(yù)I支持型工具。與放射學(xué)及眼科等單純面向某一領(lǐng)域的學(xué)科不同,據(jù)預(yù)測。AI病理學(xué)工具能夠?qū)⑸锘瘜W(xué)、免疫學(xué)乃至遺傳學(xué)領(lǐng)域的效果整合起來,從而為組織薄切片及染色樣本的圖像添加分子級別的細(xì)節(jié)觀察。

A I將大大減輕病理學(xué)家的工作壓力

曾在波士頓與合伙人共同興辦并經(jīng)營一家名為PathA I初創(chuàng)企業(yè)。表示,A ndrewH.Beck一位專業(yè)的病理學(xué)家。工具將真正改善診斷的準(zhǔn)確性與治療效果,并認(rèn)為,病理學(xué)將成為人工智能真正完全改變的第一個(gè)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。

希望能夠協(xié)助病理學(xué)家利用載玻片上的數(shù)字化活體組織圖像發(fā)現(xiàn)癌細(xì)胞或者其它患病細(xì)胞。支持者們指出,Beck并不是唯一一位對此抱有樂觀態(tài)度的人。各大軟件巨頭(包括谷歌與IBM醫(yī)療設(shè)備制造商(包括飛利浦與徠卡生物系統(tǒng)公司)以及數(shù)十家初創(chuàng)企業(yè)正在開發(fā)相關(guān)的模式識別算法。據(jù)統(tǒng)計(jì)目前只有不到2%高校畢業(yè)生愿意進(jìn)入病理學(xué)領(lǐng)域;而智能軟件的呈現(xiàn)則有望緩解全球人才短缺的現(xiàn)狀,同時(shí)減輕病理學(xué)專家和醫(yī)生的工作壓力。

同時(shí)接受過計(jì)算機(jī)科學(xué)培訓(xùn)。公司總部內(nèi),Beck自身對病理學(xué)與軟件都有著深入的理解。一位病理學(xué)家。Beck進(jìn)行了一輪PathA I平臺演示。將一局部癌變肺組織數(shù)字圖像進(jìn)行縮放,顯微鏡載玻片的規(guī)范視力與染色疊加圖之間切換,并通過突出顯示特定細(xì)胞或癌變相關(guān)蛋白做出內(nèi)容注釋。

并將其與例如腫瘤侵襲性、治療計(jì)劃與治療結(jié)果等臨床數(shù)據(jù)加以結(jié)合,利用數(shù)字載玻片圖像數(shù)據(jù)PathA I對其機(jī)器學(xué)習(xí)算法進(jìn)行了訓(xùn)練。從而實(shí)現(xiàn)遠(yuǎn)超任何頂尖人類醫(yī)師的統(tǒng)計(jì)分析能力。

PathA I模型不只能對癌細(xì)胞進(jìn)行檢測并評估腫瘤的狀態(tài),據(jù)了解。同時(shí)還能給出相關(guān)的治療建議。通過計(jì)算解圍在腫瘤周邊的免疫細(xì)胞,并判斷這些細(xì)胞是否具有某些特性的方式,考量最新的免疫療法是否奏效。

這種方式對于像Bristol-MySquibb簡稱BMS這樣的藥物開發(fā)商來說極具價(jià)值。因?yàn)锽MS一直希望借此確定為什么只有一小局部臨床試驗(yàn)參與者對抗癌藥物有所反應(yīng)。

團(tuán)隊(duì)目前正在依靠PathA I技術(shù)確定活檢樣本中的腫瘤細(xì)胞是否被偽裝蛋白質(zhì)所覆蓋—這種情況下,BMS公司翻譯病理學(xué)負(fù)責(zé)人MichaelMontalto解釋稱。免疫細(xì)胞無法將癌細(xì)胞正確識別進(jìn)去。BMS免疫治療藥物能夠有效剝開覆蓋層,從而激發(fā)病患身體對于癌細(xì)胞的殺滅功能。表示,這還只是人工智能發(fā)現(xiàn)作用的案例之一,接下來BMS還將把這項(xiàng)技術(shù)引入所有病理試驗(yàn)中。

癌癥的秘密

 

 

 

 

為了協(xié)助醫(yī)生們治愈肺部腫瘤,PathA I軟件會繪制現(xiàn)有組織類型(圖一)其中的紅色局部為指示癌癥發(fā)展的上皮細(xì)胞。此外,還制作出了一份免疫細(xì)胞圖(圖二)其中的黃色方塊指示的新的免疫治療藥物對腫瘤起到治療效果。

而在于建立起判斷每位癌癥患者腫瘤性質(zhì)的規(guī)范診斷流程并指導(dǎo)治療方案。但這一市場的建立面臨著一項(xiàng)挑戰(zhàn):即整個(gè)病理學(xué)基礎(chǔ)設(shè)施都需要隨之改變。荷蘭蘭道爾大學(xué)醫(yī)療中心計(jì)算病理學(xué)家JeroenvanderLaak指出,更重要的人工智能病理學(xué)市場的核心機(jī)遇并不在于研究環(huán)境當(dāng)中。要使用這些算法,必需首先將切片圖像進(jìn)行數(shù)字化轉(zhuǎn)錄,但現(xiàn)在大多數(shù)機(jī)構(gòu)都沒有相關(guān)的處置設(shè)施。

從而進(jìn)行歸檔或事后研究,雖然不少病理學(xué)實(shí)驗(yàn)室目前都會為載玻片樣本制作數(shù)字拷貝。但只有少數(shù)早期采用者(主要在歐洲)會進(jìn)行預(yù)先掃描以引入診斷過程。由于這項(xiàng)技術(shù)本錢高貴,因此醫(yī)院在引入自動化全切片成像設(shè)備方面進(jìn)展非常緩慢:掃描價(jià)的價(jià)格高達(dá)25萬美元,另外存儲億級像素高清圖像文件也會帶來額外的資源本錢。

俄亥俄州立大學(xué)綜合癌癥中心數(shù)字病理學(xué)負(fù)責(zé)人AnilParwani堅(jiān)持認(rèn)為這項(xiàng)投資將物有所值。該中心是全美唯一一家將切片數(shù)字掃描作為慣例診斷工作流程的機(jī)構(gòu)。Parwani解釋稱,然而。由于醫(yī)師工作效率的提高以及診斷錯誤的減少,該醫(yī)院引入的全數(shù)字平臺有望在五年之內(nèi)收回本錢。此外,數(shù)字化切片還能夠?qū)崿F(xiàn)在線文件共享,而無需寄送實(shí)體切片進(jìn)行遠(yuǎn)程診斷或收集參考意見。Parwani指出,這使得工作流程變得更為穩(wěn)定可靠。病理學(xué)家們能夠立即對間隔數(shù)月的活檢影像進(jìn)行比擬,或者在差旅途中檢查病例。

PathA I如何創(chuàng)建的

Beck布朗大學(xué)醫(yī)學(xué)院求學(xué)時(shí)開始涉足量化圖像分析。與病理學(xué)家MurraiResnick合作,2000年初。共同開發(fā)出了一款計(jì)算機(jī)程序,用于評估食道細(xì)胞的大小、形狀及其它特征,從而確定患者罹患食道癌的風(fēng)險(xiǎn)。雖然并不屬于深度學(xué)習(xí)算法,但由此激發(fā)的量化醫(yī)學(xué)興趣促使他選擇了斯坦福大學(xué),并在AI科學(xué)家DaphnKoller實(shí)驗(yàn)室中攻讀病理學(xué)博士學(xué)位。研究最終成績了ComputPathlogist簡稱C-Path系統(tǒng)的誕生,這是一款相當(dāng)原始的機(jī)器學(xué)習(xí)工具,用于評估乳腺腫瘤的嚴(yán)重水平。2011年,該小組公布了研究結(jié)果,這也成為人工智能在病理學(xué)領(lǐng)域中的首批應(yīng)用之一。

那時(shí)候“還沒人采用這種廣泛的數(shù)據(jù)驅(qū)動方法解決這類問題。之前的自動化組織分析嘗試當(dāng)中,Koller回憶道。研究人員一般會告知順序要尋找哪些特征—Beck與Resnick采取的都是這種方法。五年之前他食道癌研究中就做過類似的工作。通過C-PathBeck為他算法提供了數(shù)百項(xiàng)特征,涵蓋幾乎每一項(xiàng)他能夠想到并可以檢測得出的特征。至于剩下的工作,就交給計(jì)算機(jī)代碼處理了

而在于周邊位置—人類病理學(xué)家很少會以這樣的方式做出判斷。VandeRijn指出,借助C-PathBeck發(fā)現(xiàn)乳腺癌疾病最具可預(yù)測性的特征不在于腫瘤細(xì)胞自身。這絕對是個(gè)驚人的發(fā)現(xiàn),甚至有可能帶來新的病理學(xué)解釋方法。

Beck回到美國東部,結(jié)束了斯坦福的求學(xué)經(jīng)歷。哈佛醫(yī)學(xué)院附屬的貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心興辦了自己的研究小組。這里,退出了機(jī)器學(xué)習(xí)研究,開始關(guān)注癌癥流行病學(xué)。但在2015年,由荷蘭研究人員發(fā)起的一場國際競賽又讓他重新投身于利用人工智能顛覆世界的嘗試。

Beck團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)出一套兩步式驗(yàn)證系統(tǒng),這次競賽中。旨在確保人工智能最初標(biāo)志為“健康”所有組織塊都確實(shí)不存在癌變跡象。確定載玻片是否包括腫瘤細(xì)胞以及確定癌組織在較大組織樣本中的位置方面,其算法甚至在一定水平上超過了專業(yè)病理學(xué)家的水平。借此,Beck團(tuán)隊(duì)最終擊敗了其他22支隊(duì)伍,這場競賽當(dāng)中拔得頭籌。

這次經(jīng)歷讓他獲得了建立初創(chuàng)企業(yè)的信心。2017年1月,Beck表示。辭去了哈佛大學(xué)的終身職位,創(chuàng)立了PathA I公司。

三大決策支持工具

PathA I公司正在開發(fā)三種類型的決策支持工具:目前。

用于處置病理學(xué)家們最討厭的重復(fù)性工作的工具,第一。例如識別淋巴結(jié)中的轉(zhuǎn)移跡象以及是否存在癌細(xì)胞等簡單測定。這類工作并不困難,但卻極為耗時(shí)而且會給人類專家?guī)砭薮蟮呢?fù)擔(dān);

涉及確定癌癥的等級”工具。約翰霍普金斯大學(xué)的病理學(xué)家JohnathanEpstein指出,第二。這種關(guān)于腫瘤侵襲性的判斷“非常困難,充溢主觀性,同時(shí)也在治療當(dāng)中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。PathA I公司顧問兼泌尿外科癌癥專家Epstein正在努力訓(xùn)練可用于診斷前列腺及其它器官腫瘤的算法;

生物標(biāo)志物檢測工具。制藥企業(yè)可以借此了解哪些患者群體能夠從自己的藥物中受益。如果在臨床試驗(yàn)當(dāng)中得到驗(yàn)證,第三。那么這些算法將能夠協(xié)助醫(yī)生為患者提供個(gè)性化用藥建議。

PathA I公司已經(jīng)測試了其軟件在肺部、膀胱癌、皮膚癌、前列腺癌、乳腺癌、結(jié)腸癌以及胃癌方面的表示。Beck總結(jié)稱,截至目前。這套平臺非常易于遷移,也正因?yàn)槿绱?,才干利用其處置幾乎所有主要腫瘤疾病。隨著新項(xiàng)目與新指標(biāo)的不時(shí)引入,其表現(xiàn)也在繼續(xù)提升。